Shimabara est une ville japonaise située dans la partie nord-est de la péninsule de Shimabara, qui englobe la vallée de l’Ariake à l’est et le mont Unzen (y compris Fugendake) à l’ouest, dans la préfecture de Nagasaki, sur l’île de Kyūshū, au Japon.
Shimabara est un village-château, et était la capitale du domaine de Shimabara pendant la période Edo. Le commerce extérieur et l’activité missionnaire y étaient considérables à la fin de la période Muromachi et, au début de la période Edo, un grand pourcentage de la population de Shimabara était constitué de kirishitan (chrétiens japonais).
En raison d’une mauvaise administration, de taxes élevées et de la persécution du christianisme, la population s’est soulevée et a déclenché la rébellion dite de Shimabara en 1637, qui a été réprimée avec une extrême sévérité par le shogunat Tokugawa. Shimabara a été gouverné par une branche généalogique du clan Matsudaira de 1668 à 1774 et de 1774 à 1871.
La ville moderne de Shimabara a acquis le nom de ville le 1er avril 1940 avec la fusion de l’ancienne ville de Shimabara et de plusieurs villages voisins. Le 1er janvier 2006, la ville d’Ariake, dans le district de Minamitakaki, a été ajoutée à la ville de Shimabara. Tout au long de son histoire, Shimabara a été dominée par l’activité sismique du Mont Unzen.
En 1792, une importante éruption volcanique a provoqué un tsunami qui a détruit une grande partie de la ville, tuant environ 15 000 personnes, ce qui en fait l’une des pires catastrophes volcaniques de l’histoire du Japon. Dans l’histoire récente, des éruptions majeures se sont produites dans les années 90 et 90, entraînant des coulées pyroclastiques qui ont tué 43 personnes et forcé des centaines d’autres à évacuer. La cinquième conférence internationale sur les volcans s’est tenue à Shimabara le 19 novembre 2007.